横琴口岸及综合交通枢纽开发工程位于横琴新区，该项目东至琴海东路，西至环岛东路，南至濠江路、北至港澳大道。该项目区域北连中央商务中心、南接国际文化教育区（澳门大学）、西邻行政管理中心、东望澳门文娱区，位于“一国两制”的交汇点和“内外辐射”的结合部，同时也是横琴新区商务办公发展轴与综合服务设施发展轴的交汇点。项目总用地34.5公顷，总建设规模约130余万㎡，其中计容建筑面积84.4万㎡

第一部分：口岸通关、交通枢纽，子项包括A区B区主体建筑及B区综合管廊子项、A区B区区域及室外工程子项、C区主体建筑及南北侧交通平台子项、C区区域室外工程子项；
第二部分：口岸配套、办公、酒店，子项包括D1区主体建筑子项、D1区区域及室外工程子项、D2区主体建筑子项、D2区区域及室外工程子项；
第三部分：口岸配套、办公、公寓，子项包括E2区主体建筑子项、E2区区域及室外工程子项、E3区主体建筑子项、E3区区域及室外工程子项；
第四部分：口岸配套、口岸检查，子项包括F1区主体建筑子项、F1区区域及室外工程子项、F2区主体建筑子项、F2区区域及室外工程子项；
第五部分：区域配套，子项包括B区C区D区基坑支护子项、莲花大桥改造子项、市政道路外网子项。

横琴口岸的建设将在粤澳创新合作的基础上，建设成为一个集客流、物流于一体的“大通关”口岸，同时实现单边验放通关空间；
强化交通枢纽设施建设，引入以公共交通、轨道交通为主导的交通疏解概念，建立立体化、多层面的交通体系。实现无缝换乘和便捷通关的同时，为口岸工程及整个口岸地区提供良好的交通设施保障；
口岸综合开发区打造产业 CBD，完善口岸配套服务设施，提升口岸整体服务品质，创 新口岸与地块开发联合的运营机制，建设以粤澳合作为背景、口岸为载体、自贸产业为先导、便捷交通为保障的新型口岸综合开发项目；
工程方案从国际视野、横琴新区的经济增长点与综合效益出发，集约高效利用土地资源，完善交通与综合服务配套，提升环境品质与门户形象。工程契合横琴自贸区的特色，打造“模式创新、通关便捷、设施齐备”的国内一流口岸，将横琴口岸建设成为“智慧、绿色、花园式口岸”。